《少年派》中正值青春期的小琪很叛逆的原因主要有以下几点：
原生家庭的缺陷：小琪自幼与母亲相依为命，并不知晓自己父亲的身份。这种家庭背景让她内心缺爱，导致了她性格上的叛逆。她用一种高傲的姿态来掩饰自己内心的自卑，并渴望一个完整的幸福家庭。
对母亲生活安排的不满：小琪对母亲一手操持的生活安排心生厌恶，这种生活状态可能加剧了她内心的叛逆情绪。她希望有自己的选择和决定权，而不是被母亲完全掌控。
个人性格和成长环境的影响：小琪虽然长得漂亮，但内心却承受着因母亲作风问题而带来的耻辱和煎熬。这种压力可能促使她表现出更加叛逆的一面。同时，她的个人性格也可能使她更容易产生叛逆情绪，比如对权威的反抗、对规则的挑战等。
外部因素的诱导：在大学时，小琪遇到了师哥李西周，并在他身上看到了专业领域的指引之光和生活中的温馨陪伴。这让她不顾母亲的反对，坚决与李西周相恋，这也是她叛逆行为的一种表现。她希望通过这种方式来追求自己的幸福和自由。
综上所述，小琪的叛逆行为是多方面因素共同作用的结果，包括原生家庭的缺陷、对母亲生活安排的不满、个人性格以及成长环境等。这些因素相互交织，共同影响了她的行为和心态。
