真假美猴王的终极真相是假猴王为克隆体，克隆者或为观音，如来知晓真相但选择掩盖以维护取经大局，具体分析如下：
假猴王身份存疑：
假猴王拥有孙悟空的全部神通，包括七十二变、筋斗云、火眼金睛以及如意金箍棒，且观音、唐僧念紧箍咒时，假猴王也表现出真实反应，这表明其并非简单变化而来，而是被连身体带装备克隆出来的。
神仙妖怪的变化神通通常只是一种高阶障眼法，有一定时效性，不可能永远改变分子结构或原子属性，且孙悟空的变化分身一般不能动或暂时性能动，而假猴王却能长时间保持孙悟空的神通和装备，这进一步支持了其被克隆的观点。
克隆者身份推测：
唐僧只会念咒，无任何神通，既无动机也无能耐克隆假猴王。
如来虽有能力克隆，但若想换掉孙悟空，无需费如此大劲，直接动手即可。
观音作为取经游戏的执行导演，与孙悟空关系微妙，且孙悟空曾骂过观音，侮辱性极强，观音有动机和能力克隆假猴王以取代孙悟空。此外，在真假美猴王事件中，观音的行为也颇为可疑，如让木叉与善财按住两猴才暗念紧箍咒，以及推荐孙悟空上天庭分辨真假等，都可能是为了掩盖真相。
谛听知晓真相但选择隐瞒：
谛听拥有查全宇宙的神通，能查知三界中任何一个物种的行善作恶，它伏地一听便查到了假猴王的真相。
谛听知道真相后选择不说出来，因为它担心说出来会引发更大的麻烦，如妖精恶发骚扰宝殿、阴府不安等。同时，谛听也清楚，如果把真相说出，会给它和主人地藏带来极大麻烦，毕竟地藏也是西天派驻地狱的菩萨，与其他菩萨之间可能存在矛盾。
如来化解风波：
如来在真假美猴王事件中扮演了关键角色，他最终道破假猴王为六耳猕猴，但这一说法存在诸多疑点。
如来在说出假悟空是六耳猕猴后，又描述了其能知千里外之事、善聆音、能察理、知前后、万物皆明的神通，这些神通与观音菩萨极为相似，暗示假猴王可能与观音有关。
如来选择掩盖真相，可能是为了维护取经大局，避免引发更大的风波和矛盾。他以无边法智化解了这场危机，使得取经游戏得以继续进行。
