厦漳海底隧道作为继厦漳跨海大桥之后的第二条海上通道，将厦门火车站附近与漳州开发区南炮台连接起来。而厦漳大桥则从海沧马青路院前延伸至漳州龙海后宅，二者出口均位于漳州开发区。这一规划显示了两地交通连接的进一步加强。根据规划，厦漳海底隧道将与厦漳城际轨道R3线共线，两端分别连接漳州开发区与厦门本岛。至2020年，福建省将陆续开工建设6条城际铁路，其中两条为厦漳泉大都市区城际铁路，包括泉州—厦门—漳州城际铁路和漳州—港尾—厦门城际铁路（部分利用港尾铁路改建）。R3线全长76公里，将连接漳州中心城区，通过厦漳海底隧道延伸进厦门火车站，设计时速为120公里。厦漳城际铁路R3线的建设工期预计为48个月，如果今年年底开工，预计2020年建成通车。届时，厦门与漳州之间的交通将更加便捷，两地市区直接互通，漳州到厦门岛内只需50分钟。另一条城际铁路R1线将晚于R3线动工，全长187公里，是此次批复的6条城际铁路中最长的，将从泉州市泉港区肖厝站，经泉州、厦门至漳州，沿途经过二十几个站点。R1线将串联漳州中心城区、角美和漳州台商投资区，设计时速为160公里，有望缩短厦漳泉城际间的往来时间。铁路部门相关负责人表示，在线路设计上，两条铁路将重点考虑，让更多市民在家门口就能享受到便捷的动车服务。漳州市发改委相关负责人称，城际铁路通车后，将进一步推动厦漳泉同城化发展，漳州将受到厦门、泉州等经济较发达地区的辐射，推动第二、三产业的发展，同时促进三地间的人流、物流、信息等的融合。沿线地区的经济发展也将因此受益。
