东京奥运会代价高昂，日本在经济、防疫等多方面损失惨重，不仅未达提振经济预期，反而陷入多重困境。具体如下：
预算大幅超支：东京最初计划用74亿美元举办奥运，之后超标至154亿，而日本政府审计人员计算总支出超200亿美元，几乎是最初预测的3倍。如此巨大的资金投入，给日本财政带来了极大的压力。
场馆建设成本难以收回：耗资70亿美元翻新和修建的场馆，因禁止观众到现场，史上第一次空场办奥运，连票价都未收回，还要给观众退票，约8亿美元退票费用飞走，东京奥组委财务陷入赤字，后续开销可能还需拿日本纳税人的钱来补。
经济损失抵消效应显著：日本国内经济学家预计，损失可能已达1万亿日元，相当于抵消了六成的奥运经济效应。举办奥运会本期望拉动经济增长，结果却事与愿违，对日本经济造成了严重的负面影响。
相关产业收益落空：没有游客前来，旅游、餐饮、住宿等相关产业无法借助奥运契机获得发展，刺激经济的效应完全无法体现。原本期待通过奥运会带来大量游客，促进消费和产业繁荣的愿望化为泡影。
提前进入紧急状态：为了举办奥运，日本不得不提前6周进入新冠防疫的紧急状态，这需要投入大量的人力、物力和财力进行疫情防控工作，进一步增加了经济成本和社会负担。
防疫风险高：就算日本民众反对，奥运村不断传来新增新冠病例消息，国际奥委会也坚持举办。这使得日本面临着巨大的防疫风险，一旦疫情爆发，不仅会影响奥运会的顺利进行，还会对日本国内的疫情防控形势造成严重冲击，给民众的生命健康带来威胁。
国际奥委会收入保障优先：如果奥运办不下去，国际奥委会就得退还40亿美元的电视转播权收入，这笔巨额收入占其总收入的七成以上。而且今年奥运媒体转播商报道覆盖率预计是2016年的两倍，创历史新高。所以国际奥委会从自身利益出发，坚持举办奥运会，并未充分考虑日本的实际情况和困难。
赞助商和转播商获利：这一届奥运会在延期前赞助金额创历史新高，超过最近两届世界杯赞助金额总和；美国NPC售出奥运期间12.5亿美元国内广告，可能是其史上最赚钱的一届奥运。各方都在从奥运会中获取利益，唯独日本承担着巨大的代价和风险。
