《银河补习班》讲述了二十世纪80、90年代一对父子跨越时光收获爱与成长的亲情故事。具体剧情如下：
马皓文入狱错过儿子成长：故事主角马皓文是一位工程师，因一次意外事故入狱，这一变故使他遗憾地错过了儿子马飞七年的成长时光。这七年中，马飞缺乏父亲的陪伴与引导，在成长过程中面临诸多困惑与挑战。
马皓文独特教育给予成长空间：出狱后的马皓文，面对已经长大的儿子，没有采用传统严厉的教育方式，而是用自己独特的教育方法和满满的爱，给予马飞自由成长的空间。他注重培养儿子独立思考的能力，鼓励马飞自己去探索世界、发现问题并解决问题。例如，在日常生活中，他会引导马飞观察周围的事物，从生活中汲取知识和经验，让马飞明白学习不仅仅局限于书本和课堂。
培养儿子面对困难的勇气：马皓文深知在人生道路上会遇到各种困难和挫折，因此十分注重培养马飞面对困难的勇气。他通过自己的亲身经历，向马飞讲述如何在困境中保持乐观积极的心态，如何勇敢地迎接挑战。当马飞在生活中遇到困难想要退缩时，马皓文总是耐心地鼓励他，让他相信自己有能力克服困难，这种教育方式让马飞逐渐变得坚强和自信。
鼓励儿子找到梦想并努力：马飞面临学业问题时，在学校老师看来，他似乎没有可塑之处，是一个“学渣”。但马皓文从未放弃儿子，他鼓励马飞找到自己心中的梦想，并为之努力奋斗。马皓文认为，每个孩子都有自己的闪光点和潜力，只要找到正确的方向，就能够取得成功。他帮助马飞发现了他对航天事业的兴趣，并支持他朝着这个目标前进。
与校长求情证明儿子可造：为了证明马飞不是不可救药的学生，“学渣”也是可造之材，马皓文与校长求情，打算用一个月时间将马飞的学业提高。在这一个月里，马皓文针对马飞的学习情况，制定了个性化的学习计划，采用寓教于乐的方式激发马飞的学习兴趣。他带着马飞去野外观察自然，在实践中学习地理、生物等知识；通过做实验的方式，让马飞理解物理、化学的原理。在马皓文的悉心教导下，马飞的学习成绩有了显著提高，也让校长和其他老师对他刮目相看。
父子共同成长收获亲情：在整个过程中，马皓文和马飞不仅在学业和梦想上取得了进步，更重要的是，他们收获了深厚的亲情。马飞在父亲的关爱和引导下，逐渐成长为一个有理想、有担当的青年；而马皓文也在陪伴儿子成长的过程中，弥补了自己曾经错过的时光，实现了自我救赎。他们相互理解、相互支持，共同跨越了生活中的重重困难，这份亲情成为他们前进的动力和温暖的港湾。
